הליגה השלישית הוקמה בשנת 2018, ומאז מתקיימת ברציפות. העונה הראשונה נערכה בחוף פרישמן בתל אביב, ולאחר מכן, במשך שבע עונות ברצף – כולל העונה הנוכחית – המשחקים מתקיימים בפארק הלאומי ברמת גן באמצע השבוע, מהשעה 16:30.

הקמת הליגה נולדה מתוך צורך שזיהה אריק גילרוביץ: בשנת 2017 נרשמו למוקדמות הליגה השנייה למעלה מ-40 קבוצות, שהתחרו על שישה מקומות בלבד. כדי לאפשר לעוד שחקנים להשתלב ולשחק במסגרת תחרותית, הוחלט להקים את הליגה השלישית. בשנה הראשונה נוהלה הליגה באופן עצמאי ע"י אריק. בסיום אותה שנה צורפה הליגה רשמית לעמותה, עם מנגנון של עלייה וירידה בין הליגות.

הליגה מנוהלת בשיטה השוויצרית – כך שהמשחקים בכל מחזור נקבעים לפי תוצאות הקבוצות במחזור הקודם. לאורך השנים עבר מבנה הליגה התאמות קלות, בעיקר בנוגע למספר הקבוצות העולות והיורדות. כיום משתתפות בליגה 32 קבוצות. שלוש מהן עולות אוטומטית לליגה השנייה, ועוד שלוש מתמודדות בהצלבות מול שלוש קבוצות מהליגה השנייה.

גם בשנים שבהן לא התקיימו הליגה הראשונה והשנייה בעקבות הקורונה ובגלל המלחמה, הליגה השלישית המשיכה לפעול כרגיל. שחקנים רבים שמשחקים כיום בליגות הבכירות החלו את דרכם בליגה זו, שהפכה לכור היתוך חשוב המאפשר לצבור ניסיון ולהתקדם.